Deoxyribose הוא חד-סוכר (פנטוז) בעל 5 פחמנים שנוצר מריבוז כאשר הוא מאבד אטום חמצן אחד. הנוסחה הכימית האמפירית לדאוקסיריבוז היא C5H10O4, ובשל אובדן של אטום החמצן, הוא אינו מסכים עם הנוסחה הכללית לחד-סוכרים (CH2O) , כאשר n הוא מספר שלם.
מאפיינים פיזיים וכימיים
ניתן לייצג את הנוסחה הליניארית לדאוקסיריבוז באופן הבא: H-(C=O)–(CH2)–(CHOH)3-H. עם זאת, הוא קיים גם בצורה של טבעת סגורה של אטומי פחמן.
Deoxyribose הוא מוצק חסר צבע, חסר ריח ומסיס מאוד במים. משקלו המולקולרי הוא 134.13 גרם/מול, נקודת התכה של 91 מעלות צלזיוס. הוא מתקבל מריבוז-5-פוספט עקב פעולתם של אנזימים מתאימים במהלך התגובה הכימית להפחתה.
ההבדל בין ריבוז לדאוקסיריבוז
כפי שכבר הוזכר וכפי שהשם מרמז, דאוקסיריבוז הוא תרכובת כימית שהרכב האטומי שלה שונה מזה של ריבוז באטום חמצן אחד בלבד. כפי שמוצגבאיור למטה, לדאוקסיריבוז אין קבוצת הידרוקסיל OH על אטום הפחמן השני שלו.
Deoxyribose הוא חלק משרשרת ה-DNA (חומצה דאוקסיריבונוקלאית), בעוד שריבוז הוא חלק משרשרת ה-RNA (חומצה ריבונוקלאית).
מעניין לציין שהחד-סוכרים ארבינוז וריבוז הם סטריאואיזומרים, כלומר, הם שונים בסידור המרחבי ביחס למישור של טבעת קבוצת OH ליד אטום הפחמן השני. דאוקסיארבינוז ודאוקסיריבוז הם אותה תרכובת, אבל השם השני משמש מכיוון שמולקולה זו נגזרת מריבוז.
Deoxyribose ומידע גנטי
מכיוון שדאוקסיריבוז הוא חלק משרשרת ה-DNA, הוא ממלא תפקיד ביולוגי חשוב. DNA - מקור המידע הגנטי, מורכב מנוקלאוטידים, הכוללים דאוקסיריבוז. מולקולות דיאוקסיריבוז מקשרות נוקלאוטיד אחד למשנהו בשרשרת ה-DNA באמצעות קבוצות פוספט.
העדר קבוצת ההידרוקסיל OH בדאוקסיריבוז נמצא כמעניק גמישות מכנית לשרשרת ה-DNA כולה בהשוואה ל-RNA, אשר בתורו מאפשר למולקולת ה-DNA ליצור גדיל כפול ולהיות בצורה קומפקטית בתוך ה-RNA. גרעין התא.
בנוסף, בשל הגמישות של קשרים בין נוקלאוטידים הנוצרים על ידי מולקולות דאוקסיריבוז וקבוצות פוספט, שרשרת ה-DNA ארוכה בהרבה מ-RNA. עובדה זו מאפשרת לקודד מידע גנטי בצפיפות גבוהה.
